Фудзимару Такаги, гениальный хакер, был взят на работу в секретное отделение Службы общественной безопасности для расследования инцидента вирусной атаки в России и расшифровки карты памяти, найденной у убитого русского агента. Вместе со своим отцом, вице директором "Third-I", он должен разгадать загадку, носящую название "Кровавый Понедельник".

Рюко Матой — девушка, путешествующая вместе с гигантской половиной ножниц , похожей на алый меч, для того, чтобы найти обладателя другой половины ножниц, того человека, который убил её отца. Рюко поступает в академию Хоннодзи, которая живёт и существует в страхе перед студсоветом. Правит этой академией Сацуки Кирюин, проповедующая принцип кнута без пряника. После знакомства с одной из учениц по имени Мако, Рюко собирается освободить академию от Сацуки и узнать правду об отце.

Много лет назад древние цивилизации, известные своими передовыми технологиями, правили Землей, но в конце концов были уничтожены их неверным использованием. Они оставили сообщение в виде нерушимой пластины, написанное на древнем иврите, для последующих поколений, предупреждающее о том, что изобретения, не нашедшие верного применения, должны быть уничтожены во избежание негативных последствий. Различные военные организации, национальные армии и частные вооруженные силы стали тайно искать эти «таинственные артефакты», чтобы использовать их для собственного блага и против врагов. Корпорация Аркам и её военное крыло, Частная Армия Аркам, могут остановить этот путь саморазрушения при помощи элитных…